棕榈酰化修饰组学

棕榈酰化修饰组学

修饰蛋白质组

产品简介

蛋白质S-棕榈酰化修饰(S-palmitoylation,亦称S-acylation,简称棕榈酰化)是常见的一类脂质修饰,通过硫酯键将来源于棕榈酸的棕榈酰辅酶A共价连接至蛋白质的半胱氨酸(C)残基上。该修饰在癌症、神经退行性疾病及免疫调控中发挥重要作用。近年来,随着高灵敏度质谱技术和生物信息学的快速发展,棕榈酰化修饰组学应运而生。作为一门新兴的组学方向,它致力于研究棕榈酰化修饰对蛋白质功能的调控作用,以及其在细胞信号转导、膜定位和蛋白相互作用中的关键机制,棕榈酰化修饰组学为疾病机制研究、靶点发现及精准治疗提供了全新视角,展现出重要的科研价值与临床转化潜力。

微纳菲生物基于经典ABE(Acyl-Biotin Exchange)方法的棕榈酰化修饰组学产品,结合高深度质谱平台,实现对组织、细胞等多种生物样本中棕榈酰化的高灵敏度、高覆盖度检测分析。该技术方案可系统解析棕榈酰化修饰在细胞信号转导、膜定位及蛋白互作中的调控网络,助力科研人员深入揭示棕榈酰化对生命活动的调控机制,为疾病机制研究、靶点发现及精准治疗提供有力支持。

技术流程

棕榈酰化修饰蛋白质组学实验基本流程为:采用经典的酰基-生物素交换法(ABE)将蛋白质棕榈酰化修饰被还原为游离巯基(-SH)并被标记上生物素,随后进行酶切,并使用链霉亲和素磁珠特异性富集标记有生物素的肽段(原棕榈酰化肽段),随后洗脱肽段并使用质谱仪进行检测。由于棕榈酰化位点在质谱检测前已经转化为烷基化修饰(固定修饰),因此最终搜库即可确定原棕酰化位点。

技术流程

棕榈酰化修饰蛋白质组学实验流程

数据分析

标准数据分析内容

1、差异棕榈酰化肽段筛选与分析:

  • 棕榈酰化位点定量结果
  • 棕榈酰化位点鉴定结果
  • 差异棕榈酰化位点分析
  • 棕榈酰化位点聚类分析棕榈酰化肽段motif分析


2、差异棕榈酰化肽段所属蛋白的功能分析

  • GO功能注释与富集
  • KEGG pathway 注释与富集
  • 亚细胞定位分析(CC)蛋白功能互作网络(PFIN)分析

送样要求

样品类型
常规动物组织(脑、肝、脾、肺、肾、肌肉等)
送样量
300mg
样品类型
植物组织(叶、花等)
送样量
2g
样品类型
细胞
送样量
6*10^7
样品类型
纯蛋白
送样量
6mg

参考文献

[1]

Zhou, Bo , et al Low-Background Acyl-Biotinyl Exchange Largely Eliminates the Coisolation of Non-S-Acylated Proteins and Enables Deep S-Acylproteomic Analysis Analytical Chemistry, 2019; 91.15.

[2]

Mesquita, Francisco S. , et al Mechanisms and functions of protein S-acylation Nat Rev Mol Cell Biol, 2024;25(6):488-509.

深圳市微纳菲生物技术有限公司

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