pro定量蛋白组

pro定量蛋白组

蛋白质组学

产品简介

随着蛋白质分析技术和质谱仪性能的提升,蛋白质组学的DIA定量方法已经从初始的DIA升级到4D-DIA进而Astral Zoom DIA,数据解析也从最初的参考DDA谱图库,到非依赖数据库检索到结合机器学习辅助解析DIA质谱原始谱图,使得DIA定量兼顾高通量、高深度、高准确度等优点,成为目前蛋白组学分析的主流分析技术,应用范围覆盖了常规样品、临床样品、微量样品到单细胞样品。

DDA与DIA

DDA方法随机选择且更偏好信号高的多肽进行碎裂、采集信息,低丰度多肽的鉴定和定量成为很大的挑战。DIA方法将所有多肽根据分子量分为若干个窗口,窗口内多肽不通过丰度区分。窗口中所有多肽都会共同碎裂、采集数据,从而无遗漏、无差异采集所有多肽的质谱数据。

Pro定量蛋白组1@2x.jpg

DDA与DIA方法示意图。DDA采集的所有质谱图均来源于高丰度单个多肽,DIA采集的为混合多肽图谱,包含了低丰度多肽


Pro-DIA(4D)

基于timsTOF HT离子淌度平台的DIA技术,在传统DIA的基础之上增加了第4维度-离子淌度(ion mobility)。离子淌度主要根据离子的形状和截面对离子进行分离,能够区分m/z差值非常小的肽段,使低丰度蛋白信号能够被区分和识别出来。DIA结合PASEF(同步累积连续碎裂)与TIMS(离子迁移谱),可重复测量所有检测离子的碰撞截面(CCS),能更快、更灵敏的进行蛋白质组定性和定量,相比于传统方法可以全面提升蛋白质鉴定覆盖率、重现性和定量准确性。

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4D-DIA分析流程图

Plus-DIA(Zoom)

Astral Zoom作为Astral的升级款,实现高通量、深覆盖、高灵敏度和高可靠定量的完美平衡。在其平台上开发的Plus-DIA定量组学可实现更少样品鉴定更高深度,支持更全面的蛋白质序列覆盖和通路注释,从而揭示更多生物学信息。

Pro定量蛋白组3@2x.jpg

与Astral质谱仪相比,Astral Zoom质谱仪的蛋白质和肽段覆盖深度更高。数据来源于官方




技术流程

技术流程

Pro定量蛋白组技术流程示意图

送样要求

样品类型
悬浮培养细胞
规格
0.5-1千万,重复≥3
样品类型
贴壁培养细胞
规格
0.5-1千万,重复≥3
样品类型
细胞培养上清
规格
5-10mL,重复≥3
样品类型
软组织(脑、肝、肌肉等)
规格
10-50mg,动物≥6,临床>15
样品类型
软体动物(线虫、血吸虫等)
规格
50-100mg,动物≥6,临床>15
样品类型
脂肪组织(白色)
规格
0.1-1g,动物≥6,临床>15
样品类型
坚韧组织-软骨
规格
50-200mg,动物≥6,临床>15
样品类型
坚韧组织-硬骨
规格
0.1-1g,动物≥6,临床>15
样品类型
坚韧组织-毛发
规格
50-200mg,动物≥6,临床>15
样品类型
血清/血浆
规格
100-300ul,动物≥6,临床>15
样品类型
脑脊液、关节液、淋巴液、附睾腔液
规格
50-200ul,动物≥6,临床>15
样品类型
唾液、泪液
规格
100-500ul,动物≥6,临床>15
样品类型
尿液
规格
3-10ml,动物≥6,临床>15
样品类型
FFPE
规格
10um×1cm^2, 动物≥6,临床>15
样品类型
植物柔软组织
规格
100-500mg,重复≥6
样品类型
木本科树根、树皮、树枝等
规格
0.3-1g,重复≥6
样品类型
果实、种子
规格
100-200mg,重复≥6
样品类型
花粉
规格
50-100mg,重复≥6
样品类型
菌类(菌体沉淀)
规格
1-5千万/0.1-2g,重复≥3

深圳市微纳菲生物技术有限公司

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