单细胞蛋白质组

单细胞蛋白质组

蛋白质组学

产品简介

在生命科学的探索中,基因组与转录组虽绘就了生命的“蓝图”,但蛋白质作为功能的核心执行者,才是决定细胞表型与命运的真正“建设者”。传统的群体水平(Bulk)研究因“平均值”效应掩盖了细胞间宝贵的异质性真相,加之翻译调控、蛋白降解等机制使得mRNA与蛋白质丰度的相关性往往不足0.5,这意味着单凭基因组与转录组水平的分析,生命活动中近一半的关键调控信息仍处于观测盲区。单细胞蛋白质组学技术的出现,通过高灵敏度检测直接还原细胞生理状态的“真实值”,不仅填补了从转录到表型之间的认知鸿沟,更突破性地捕捉到决定蛋白活性的磷酸化、乙酰化等翻译后修饰(PTM)开关。这种从“图纸”到“执行层”的深度解析,赋能科研人员在单细胞极微尺度下透视肿瘤演化、免疫响应及发育过程中的功能差异,为解析复杂生命现象、锁定临床药靶及实现精准医疗提供了最接近生命本质的像素级视窗。

技术流程

单细胞制备→微量样品前处理→液相色谱分离→高灵敏度质谱检测→生物信息学分析

技术流程

技术优势

① 微纳菲生物拥有华南区商业公司首台千万级Astral zoom质谱仪,也是目前世界上最顶级质谱仪,具有更高的灵活性、更高的通量、更深的覆盖度、更高的灵敏度和更精准的定量;

② Astral 扫描速度高达 200 Hz。结合 Zoom 模式 优化离子处理,单样分析时间可缩短至几分钟。能够支撑数千甚至上万个单细胞的大规模队列研究(如临床大规模样本分型),使蛋白质组学真正具备了与单细胞转录组(scRNA-seq)同等规模的统计学效能;

③ Astral 具有极高的离子传输效率和离子积聚能力。即使是微弱的信号,也能在极短时间内积聚足够的离子进行高质谱分析。能够检测到传统仪器无法捕捉到的转录因子、激酶及信号转导蛋白。这对于研究“细胞命运决定”等微细生物学过程至关重要。

送样要求

样品
培养细胞(悬浮/贴壁)
规格
≥1×10^6
注意事项
细胞活性>90%。细胞应长势良好,处于对数生长期,寄送时将培养瓶灌满培养基,常温送样
样品
分离单细胞
规格
目标分析量×120%
注意事项
干冰运输
样品
冻存细胞
规格
≥1×10^6
注意事项
冻存前细胞量≥1×10^6,细胞活性>90%,冻存液配方:90%FBS+10%DMSO。使用程序降温冻存法或者梯度冻存盒,放于液氮储存或者-80℃一周内送样
样品
生殖细胞(卵母细胞/受精卵)
规格
≥1个
注意事项
细胞放入ep管中干冰运输
样品
血液类
规格
≥2mL
注意事项
新鲜采集于EDTA抗凝管中,4℃运输
样品
组织类
规格
≥200mg
注意事项
采集后立即保存在组织保护液中,4℃运输

注意:新鲜采集的样品均需要尽快寄送到实验室,防止储存或者运输过程中影响样品状态

参考文献

SCoPE-MS:单哺乳动物细胞质谱法量化细胞分化过程中蛋白质组的异质性

SCoPE-MS: mass spectrometry of single mammalian cells quantifies proteome heterogeneity during cell differentiation


通过 Orbitrap Astral Zoom 质谱仪中的并行预积聚与优化离子处理实现更高通量的蛋白质组分型

Higher-Throughput Proteome Profiling Enabled by Parallelized Pre-Accumulation and Optimized Ion Processing in the Orbitrap Astral Zoom Mass Spectrometer


利用先验信息指导的 DIA 技术实现单细胞水平下细胞命运决定关键调控蛋白的靶向定量

Informed Data-Independent Acquisition Enables Targeted Quantificationof Key Regulatory Proteins in Cell Fate Decision at Single-Cell Resolution

深圳市微纳菲生物技术有限公司

创新质谱与人工智能技术,为生命科学研究提供蛋白代谢质谱多组学解决方案,赋能生物与医药大健康产业发展。

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