TPP

TPP

药物靶点蛋白组

产品简介

热蛋白质组学分析(thermal proteome profiling, TPP),亦称MS-CETSA,是细胞热漂移测定(CETSA)与定量质谱(MS)技术的整合方法。该技术通过检测不同加热温度下细胞或细胞裂解液中可溶性蛋白的丰度变化,系统评估整个蛋白质组的热稳定性。蛋白质在与小分子(如药物或代谢物)、核酸或其他蛋白质相互作用,或经历翻译后修饰时,其热稳定性可能发生改变。TPP利用配体结合前后蛋白质热稳定性的差异,实现对靶蛋白的识别。目前,TPP已成功应用于药物靶点及脱靶效应的鉴定,以及蛋白质-代谢物和蛋白质-蛋白质相互作用的研究。

图1.热蛋白组学原理图@2x.jpg

图1.热蛋白组学原理图

技术流程

技术流程

图2.热蛋白组学技术路线示意图

案例应用

英文标题Identifying drug targets in tissues and whole blood with thermal-shift profiling

影响因子41.7

发表期刊Nature Biotechnology

研究内容该研究开发了组织热蛋白质组学(tissue-TPP)和全血热蛋白质组学(blood-TPP)技术,用于在动物组织和人体全血中无偏地识别小分子药物的靶点及脱靶蛋白。以组蛋白去乙酰化酶抑制剂帕比司他为例,在大鼠肝、肺、肾、脾中不仅检测到已知靶点的稳定性变化,还发现了器官特异性的脱靶蛋白。同时,通过全血-TPP分析,在人体血液中鉴定了帕比司他对锌指蛋白ZNF512的稳定化作用,该作用依赖其羟肟酸基团,且为其他HDAC抑制剂所共有。这些热蛋白组学实验揭示了药物-蛋白相互作用在体内的组织选择性和新脱靶,为理解药物作用机制和潜在不良反应提供了关键分子证据。

案例应用

英文标题Systematic analysis of drug combinations against Gram-positive bacteria

影响因子19.4

发表期刊Nature Microbiology

研究内容该研究系统性筛选了针对三种革兰氏阳性菌的数千种药物组合,发现了大量未被报道的协同或拮抗作用,并验证了部分协同组合在耐药菌感染模型中的体内外有效性。其中,通过热蛋白组学分析进一步揭示了抗血小板药物替格瑞洛的作用机制。

案例应用

送样要求

样本
细胞
规格
T75 /组
备注
1*10^7/组
样本
细菌
规格
OD600~0.6 /组
备注
样本
组织
规格
100mg /组
备注
样本
小分子药
规格
100 mM,50 uL
备注
需告知给药浓度及配制溶剂
样本
DMSO
规格
50 uL
备注

参考文献

[1]

Perrin J, Werner T, Kurzawa N, et al Identifying drug targets in tissues and whole blood with thermal-shift profiling Nat Biotechnol, 2020;38(3): 303-308.DOI: 10.1038/s41587-019-0388-4

[2]

Cacace E, Kim V, Varik V, et al Systematic analysis of drug combinations against Gram-positive bacteria Nat Microbiol, 2023;8(11): 2196-2212.DOI: 10.1038/s41564-023-01486-9

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