产品简介
有限蛋白水解-质谱联用技术（Limited Proteolysis-mass Spectrometry，LiP-MS）是一种基于质谱的结构蛋白质组学技术，主要用于高通量、无标记地检测蛋白质构象变化、药物靶标识别以及翻译后修饰（PTM）的影响。其核心原理是：当药物或配体与靶蛋白结合时，会诱导蛋白质局部构象发生改变，从而影响广谱蛋白酶（如蛋白酶K）对其特定区域的切割效率。通过质谱定量比较处理组与对照组中肽段丰度的差异，即可精准识别发生结合或构象变化的蛋白质及其结合区域。该技术无需对药物进行化学修饰，可在近生理条件下高通量筛选直接作用靶点，并能提供结合位点信息，因此在药物靶点发现、蛋白质相互作用网络及疾病标志物研究中发挥着重要作用。
图1.LiP-MS原理图
技术流程
图2.LiP-MS技术路线示意图
案例应用
英文标题：The phytochemical hyperforin triggers thermogenesis in adipose tissue via a Dlat-AMPK signaling axis to curb obesity
影响因子：30.9
发表期刊：Cell Metabolism
研究内容：该研究利用Connectivity Map筛选出天然化合物贯叶金丝桃素能够模拟冷暴露诱导的脂肪组织产热基因表达谱，进而通过体内外实验证实HPF可激活AMPK-PGC1α-Ucp1信号轴，促进白色脂肪棕色化和棕色脂肪活化，从而抑制肥胖。为阐明其直接分子靶点，作者采用有限蛋白酶解-质谱联用技术（LiP-SMap）对HPF处理的脂肪细胞裂解液进行分析，最终鉴定出二氢硫辛酰胺S-乙酰转移酶（Dlat）为HPF的直接结合蛋白，并通过微量热泳动、分子对接及结构域缺失突变等实验验证了Dlat的C末端内结构域（I domain）是HPF结合并激活AMPK所必需的关键区域。
英文标题：Global analysis of aging-related protein structural changes uncovers enzyme-polymerization-based control of longevity
影响因子：16.6
发表期刊：Molecular Cell
研究内容：该研究利用有限蛋白酶解-质谱联用技术（LiP-MS）系统分析了酿酒酵母衰老过程中蛋白质结构的全局变化，共鉴定出468个发生年龄相关结构改变的蛋白，主要富集于翻译、蛋白质稳态和氨基酸代谢等通路。通过LiP-MS定位的结构变化区域，发现谷氨酸合酶Glt1在衰老细胞中通过其保守界面发生可逆性聚合，导致胞内氨基酸失衡、线粒体功能受损并缩短寿命；而阻断Glt1聚合则能恢复氨基酸稳态、改善线粒体功能并延长寿命。
送样要求
- 样本
- 细胞
- 规格
- T75 /组
- 备注
- 1*10^7/组
- 样本
- 细菌
- 规格
- OD600~0.6 /组
- 备注
- 样本
- 组织
- 规格
- 100mg /组
- 备注
- 样本
- 小分子药
- 规格
- 100 mM，50 uL
- 备注
- 需告知给药浓度及配制溶剂
- 样本
- DMSO
- 规格
- 50 uL
- 备注
| 样本 | 规格 | 备注 |
|---|---|---|
| 细胞 | T75 /组 | 1*10^7/组 |
| 细菌 | OD600~0.6 /组 | |
| 组织 | 100mg /组 | |
| 小分子药 | 100 mM，50 uL | 需告知给药浓度及配制溶剂 |
| DMSO | 50 uL |
参考文献
Piazza I, Kochanowski K, Cappelletti V, et al A Map of Protein-Metabolite Interactions Reveals Principles of Chemical Communication Cell, 2018;172(1-2):358-372.e23.DOI: 10.1016/j.cell.2017.12.006
Holfeld A, Quast JP, Bruderer R, et al Limited Proteolysis-Mass Spectrometry to Identify Metabolite-Protein Interactions. Methods Mol Biol Methods Mol Biol, 2023;2554:69-89.DOI: 10.1007/978-1-0716-2624-5_6
Chen S, Liu X, Peng C, et al The phytochemical hyperforin triggers thermogenesis in adipose tissue via a Dlat-AMPK signaling axis to curb obesity Cell Metab, 2021;33(3):565-580.e7.DOI: 10.1016/j.cmet.2021.02.007
Paukštytė J, López Cabezas RM, Feng Y, et al Global analysis of aging-related protein structural changes uncovers enzyme-polymerization-based control of longevity Mol Cell, 2023;83(18):3360-3376.e11.DOI: 10.1016/j.molcel.2023.08.015. Epub 2023 Sep 11
深圳市微纳菲生物技术有限公司
创新质谱与人工智能技术，为生命科学研究提供蛋白代谢质谱多组学解决方案，赋能生物与医药大健康产业发展。
