FFPE

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微量蛋白质组

产品介绍

FFPE(石蜡切片)蛋白质组学,FFPE(Formalin Fixed Paraffin Embedded,福尔马林固定石蜡包埋)处理能够较长时间地保持组织细胞原始的病生理状态。因其制作流程相对简易成熟,成本较低,且保存条件简单(室温保存即可),因而长期大量地应用于生物学研究和临床病理学检测,也是目前病理样本长期保存的金标准。目前FFPE样本存档量十分巨大,且承载着海量的珍惜病生理信息,亟待深入挖掘。

甲醛固定及石蜡包埋会导致组织细胞中的蛋白质和核酸等生物分子发生广泛的分子交联,极大地降低了FFPE 样本的蛋白质提取效率、蛋白酶切效率及碎裂粒子的图谱利用率(鉴定效率)。我们采用高效FFPE蛋白质提取技术结合Astral Zoom最强质谱平台,可极大地增加样本的鉴定深度,有效推动FFPE样本的利用和相关疾病的研究,充分挖掘FFPE样本的基础研究及临床价值。

技术流程


技术流程

FFPE技术流程图

案例展示

FFPE蛋白组学项目结果展示

案例展示

左上图:组间蛋白数量;右上图:蛋白表达的组间性;下图:分子通路富集分析

送样要求

样品
3切片/样,~1cm^2/片
数量
重复≥15

[1]

Pu J et al Highly Accurate and Robust Absolute Quantification of Target Proteins in Formalin-Fixed Paraffin-Embedded (FFPE) Tissues by LC-MS Anal Chem, 2023 Jan 17;95(2):924-934.

[2]

Soni RK rotocol for deep proteomic profiling of formalin-fixed paraffin-embedded specimens using a spectral library-free approach STAR Protoc, 2023 Sep 15;4(3):102381.

[3]

Mitsa G et al A Non-Hazardous Deparaffinization Protocol Enables Quantitative Proteomics of Core Needle Biopsy-Sized Formalin-Fixed and Paraffin-Embedded (FFPE) Tissue Specimens Int J Mol Sci, 2022 Apr 18;23(8):4443.

深圳市微纳菲生物技术有限公司

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